Zdravotná dokumentácia predstavuje kľúčový nástroj pri poskytovaní zdravotnej starostlivosti a zároveň slúži ako právne významný záznam o zdravotnom stave pacienta a o vykonaných diagnostických a terapeutických postupoch. V slovenskom právnom poriadku je jej vedenie upravené najmä v zákone č. 576/2004 Z. z. o zdravotnej starostlivosti, službách súvisiacich s poskytovaním zdravotnej starostlivosti a o zmene a doplnení niektorých zákonov, konkrétne v § 19 a § 20. Zdravotná dokumentácia je súbor údajov o zdravotnom stave osoby, o zdravotnej starostlivosti a o službách súvisiacich s poskytovaním zdravotnej starostlivosti tejto osobe. Tieto údaje sú zaznamenávané počas celého procesu poskytovania zdravotnej starostlivosti a majú medicínsky, právny aj administratívny význam.

Zodpovednosť za bezpečné vedenie, uchovávanie a ochranu zdravotnej dokumentácie nesie výlučne poskytovateľ zdravotnej starostlivosti. Ten je povinný zabezpečiť, aby počas celého obdobia uchovávania nedošlo k poškodeniu, strate, zničeniu alebo zneužitiu dokumentácie. Zákon špecifikuje aj lehoty uchovávania:

• dokumentácia vedená všeobecným lekárom sa uchováva 20 rokov po smrti pacienta,
• ostatná dokumentácia sa uchováva 20 rokov od posledného poskytnutia zdravotnej starostlivosti.

Od 1. januára 2025 vstúpili do účinnosti zmeny zákona, ktoré upravujú aj odovzdávanie zdravotnej dokumentácie medzi poskytovateľmi.  

V prípade, ak zaniká poskytovateľ zdravotnej starostlivosti a zároveň existuje poskytovateľ, ktorý prevezme jeho pacientov, odovzdanie a prevzatie zdravotnej dokumentácie môže prebehnúť aj priamo medzi poskytovateľmi v prípade, že tak rozhodne samosprávny kraj. Ten tak nemusí prevziať zdravotnú dokumentáciu do úschovy. Ak samosprávny kraj rozhodne o priamom odovzdaní a prevzatí zdravotnej dokumentácie medzi poskytovateľmi, odovzdanie a prevzatie zdravotnej dokumentácie prebehne za prítomnosti zástupcu samosprávneho kraja. O odovzdaní a prevzatí sa vyhotoví protokol, ktorý obsahuje identifikačné údaje poskytovateľa, ktorý zdravotnú dokumentáciu odovzdáva, identifikačné údaje poskytovateľa, ktorý zdravotnú dokumentáciu preberá, meno a priezvisko zástupcu samosprávneho kraja, menný zoznam pacientov vrátane ich rodného čísla, dátum a čas odovzdania a prevzatia zdravotnej dokumentácie a podpisy poskytovateľov zdravotnej starostlivosti a zástupcu samosprávneho kraja.